2020年
3月，临床医学专业通过教育部认证，有效期五年。
5月，学校首个临床学系——消化病学系成立，附属中山医院任建林教授任首任主任。
6月，健康大数据与智能医学交叉学科获批。
10月 神经科学系、血液病学系成立。
12月，福建省眼再生医学工程研究中心获批，为学院首个省级工程研究中心；
12月，韩家淮院士领衔“细胞应激研究创新单元”入选中国医学科学院创新单元。
2021年
2月，耳鼻咽喉头颈外科学系成立。
4月，妇产科学系成立。
9月，儿科学系成立。
10月19日，陈怀锋任医学院党委书记。
2022年
3月，福建省乳腺癌精准诊治重点实验室获批建设。
6月，临床医学专业获批国家级一流本科专业建设点。
9月，中西医结合学系成立。
2023年
1月， 王科嘉课题组研究成果发表于《Cell》。
3月， 王鑫课题组唐氏综合征认知损伤机制研究刊发于《Cell》。
5月， 龙岩市中医院挂牌厦门大学附属龙岩中医院；
5月，李峰任医学院党委书记。
5月，刘祖国教授团队获批教育部干眼医药基础研究创新中心，实现学院部级科研平台零突破。
9月，基础医学一级学科博士点获批。
10月，心血管科学学系成立。
12月，中医学专业通过教育部认证，有效期六年。
2024年
9月，临床医学博士专业学位授权点、中医硕士专业学位授权点获批。
2025年
4月，眼科学系成立。
5月，厦门大学校总会医学分会成立，肖传兴当选理事长。
9月，厦门大学基础医学拔尖学生培养基地入选国家首批基础学科拔尖学生培养基地。
12月，临床医学来华留学生英文授课本科项目通过教育部质量认证，有效期5年。